Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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