Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc113Q8C5T8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms