Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms