Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms