Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC102431.2-201ENSMUST00000224071 2448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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