Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ctdsp2Q8BX07 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ctdsp2Q8BX07 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ctdsp2Q8BX07 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ctdsp2Q8BX07 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctdsp2Q8BX07 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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