Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms