Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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