Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Amigo1Q80ZD8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Amigo1Q80ZD8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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