Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC061212Q6P8K3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms