Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg2aQ6P4T0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms