Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Krt77Q6IFZ6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Krt77Q6IFZ6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Krt77Q6IFZ6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Krt77Q6IFZ6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms