Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clcn1Q64347 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms