Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms