Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms