Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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DbpQ60925 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DbpQ60925 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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