Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms