Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Tmem40Q4FJU9 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmem40Q4FJU9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Atxn7l1os1-201ENSMUST00000155877 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms