Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Shisa3Q3UPR0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Shisa3Q3UPR0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa3Q3UPR0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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