Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trafd1Q3UDK1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms