Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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