Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp39Q3TIX9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Usp39Q3TIX9 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms