Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms