Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms