Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms