Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxc4Q08624 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms