Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CbfbQ08024 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms