Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cdk18Q04899 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms