Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nme2Q01768 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms