Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Apoa1Q00623 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms