Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pitx2P97474 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms