Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms