Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
H3f3aP84244 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms