Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Hoxd13P70217 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxd13P70217 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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