Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nphp4P59240 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms