Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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