Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp1P55194 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp1P55194 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms