Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl5P50228 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl5P50228 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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