Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms