Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VdrP48281 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms