Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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LtbP41155 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms