Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BgnP28653 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BgnP28653 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BgnP28653 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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