Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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