Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms