Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkchP23298 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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