Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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