Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18532 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P18532 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms