Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcnaP17918 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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