Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms