Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prf1P10820 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms